Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Ccnd2-201ENSMUST00000000188 6330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms