Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rpp38Q80UU2 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rpp38Q80UU2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpp38Q80UU2 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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