Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5460Q3UQ97 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms