Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms