Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Traf3ip1Q149C2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms