Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 AC093022.2-202ENSMUST00000227500 866 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms