Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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