Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Apex2-202ENSMUST00000112719 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Plscr5-201ENSMUST00000179751 1191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm37065-202ENSMUST00000192000 568 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm42871-201ENSMUST00000199333 315 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Scp2-ps2-201ENSMUST00000072166 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Rufy3-202ENSMUST00000196686 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Sult6b2-201ENSMUST00000111768 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Brd9-206ENSMUST00000222399 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Serpina10-202ENSMUST00000121625 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm45538-201ENSMUST00000210771 1061 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm16104-201ENSMUST00000156260 401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 AC159244.2-201ENSMUST00000222051 220 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Psme1-201ENSMUST00000089619 711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt1P13864 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms