Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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