Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm2035J3QP87 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms