Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Defa21-201ENSMUST00000076754 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm33180-201ENSMUST00000217109 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Etfbkmt-201ENSMUST00000047531 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Pip5k1bos-201ENSMUST00000126936 684 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm13405-201ENSMUST00000146769 708 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Usp9yF8VPU6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Usp9yF8VPU6 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms