Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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