Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms