Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms