Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rnf6Q9DBU5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf6Q9DBU5 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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