Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms