Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9CPS8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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