Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms