Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms