Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Cep63-206ENSMUST00000162655 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tulp2-209ENSMUST00000210813 2153 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Cyld-210ENSMUST00000211554 4638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Zfp655-202ENSMUST00000167316 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Gm9955Q8CEJ8 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Jarid2-210ENSMUST00000173704 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Pitpnm2os1-201ENSMUST00000161697 1618 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm9955Q8CEJ8 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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