Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms