Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc90bQ8C3X2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc90bQ8C3X2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc90bQ8C3X2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc90bQ8C3X2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc90bQ8C3X2 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc90bQ8C3X2 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc90bQ8C3X2 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccdc90bQ8C3X2 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms