Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms