Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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