Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Nps-203ENSMUST00000210907 1206 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NipblQ6KCD5 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
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NipblQ6KCD5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NipblQ6KCD5 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NipblQ6KCD5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NipblQ6KCD5 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
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