Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms