Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms