Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp48Q3V0C5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp48Q3V0C5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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