Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Kdm5aQ3UXZ9 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Kdm5aQ3UXZ9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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