Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms