Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms