Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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