Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Srsf6Q3TWW8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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