Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms