Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GscQ02591 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GscQ02591 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GscQ02591 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GscQ02591 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GscQ02591 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GscQ02591 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms