Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbdsP70122 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms