Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3aP47708 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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