Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TtrP07309 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms