Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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H2-Eb1P04230 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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H2-Eb1P04230 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
H2-Eb1P04230 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms