Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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