Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Srp72F8VQC1 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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