Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms