Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm23976-201ENSMUST00000175001 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm22463-201ENSMUST00000175274 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm22547-201ENSMUST00000175281 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm22913-201ENSMUST00000175297 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm23282-201ENSMUST00000175306 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm25972-201ENSMUST00000175374 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm22414-201ENSMUST00000175466 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm26235-201ENSMUST00000175533 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm25084-201ENSMUST00000175556 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm23646-201ENSMUST00000178119 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm24643-201ENSMUST00000178305 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm24302-201ENSMUST00000178350 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm26386-201ENSMUST00000178407 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm25458-201ENSMUST00000178981 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms