Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprsB0V2N1 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprsB0V2N1 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprsB0V2N1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprsB0V2N1 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprsB0V2N1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprsB0V2N1 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprsB0V2N1 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprsB0V2N1 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PtprsB0V2N1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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PtprsB0V2N1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtprsB0V2N1 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms