Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm6880A3KG45 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm6880A3KG45 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm6880A3KG45 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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