Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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