Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pias4Q9JM05 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pias4Q9JM05 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms