Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D1F3 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms