Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Khdc3Q9CWU5 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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