Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc28aQ8CEI3 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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